LINE-1 retrotransposition is a recurrent cause of MET exon 14 skipping in cancer
该研究首次发现长散在核元件 -1（LINE-1）逆转录转座插入是导致 MET 外显子 14 跳跃的复发性致病机制，并报道了九例此类可临床干预的癌症病例。
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cancer biology
411 篇论文
Targeting tRNA-Arg-TCT-4-1 suppresses cancer cell growth and tumorigenesis
该研究证实 tRNA-Arg-TCT-4-1 是多种癌症的不良预后标志物，并表明通过反义寡核苷酸（ASO）特异性抑制该 tRNA 可重塑翻译过程、抑制肿瘤生长并延长小鼠模型生存期，从而确立了其作为新型抗癌治疗靶点的潜力。
Cholesterol Biosynthesis is a Targetable Vulnerability of CEBPA-mutant Acute Myeloid Leukemia
该研究通过基因编辑构建人源 CEBPA 突变 AML 模型，揭示 CEBPA-p30 与 TET2/WT1 共突变驱动白血病发生并导致胆固醇生物合成依赖性，从而确立了胆固醇合成通路作为此类患者潜在的治疗靶点。
CDK12/13 inhibitor, CTX-439, suppresses tumor growth and potentiates BCL-2 family blockade
该研究报道了一种新型口服 CDK12/13 抑制剂 CTX-439，其通过转录通读下调 MCL1 蛋白水平，从而将细胞存活依赖性转移至 BCL-2/BCL-xL，进而与 BCL-2 家族抑制剂联用可显著抑制肿瘤生长并克服耐药性。
Extrachromosomal DNA micronucleation constrains tumour fitness andimproves patient survival
该研究发现，携带致癌基因的染色体外 DNA（ecDNA）在细胞分裂中易错误分配至微核，导致其转录活性降低并限制肿瘤细胞增殖，进而改善神经母细胞瘤患者的生存预后。
Super-resolution microscopy reveals distinct epigenetic states regulated by estrogen receptor activity
该研究利用超分辨率显微镜揭示了雌激素受体（ER）活性通过动态调控 H3K27ac 修饰染色质的结构状态（从激活态的开放延展构象转变为抑制态的致密球状构象）来区分增强子的活性，并指出 ER 突变导致的持续开放染色质状态是乳腺癌内分泌治疗耐药的新机制。
EZH2 Inhibition Induces a Metabolic Stress Response Sensitizing TNBC to Glutaminase Targeting
该研究发现，EZH2 抑制剂在诱导三阴性乳腺癌（TNBC）产生由 PKR 和 PERK 介导的整合应激反应后，会触发 ATF4 依赖的谷氨酰胺代谢适应以维持细胞存活，因此联合使用谷氨酰胺酶抑制剂可显著增强 EZH2 抑制剂对 TNBC 的疗效。
HIF-1 regulated TPM3 links hypoxia to motility and invasion beyond the hypoxic fraction in triple-negative breast cancer
该研究揭示在三阴性乳腺癌中，缺氧通过 HIF-1 上调肌动蛋白结合蛋白 TPM3，进而驱动细胞骨架重组、侵袭转移及细胞间通讯，并显示抑制 TPM3 可增强化疗疗效，使其成为极具潜力的治疗靶点。
The SF3B1 inhibitor pladienolide B massively inhibits DNA damage signaling and repair and counteracts resistance to platinum salts in Non-Small Cell Lung Cancer
该研究表明，剪接体核心成分 SF3B1 抑制剂 pladienolide B 通过诱导基因组不稳定性、抑制 DNA 损伤修复信号通路（特别是导致 MLH3 外显子 8 跳跃）以及增强铂类药物敏感性，有效克服了非小细胞肺癌对铂盐化疗的耐药性。
Unsupervised anomaly detection for tumor delineation in a preclinical model of glioblastoma using CEST MRI
该研究提出了一种基于化学交换饱和转移（CEST）磁共振成像的无监督异常检测框架，利用 1D 卷积自编码器分析健康组织的 Z 谱分布以识别胶质母细胞瘤的代谢异常，在无需大量标注数据的情况下实现了高精度的肿瘤分割，并证明了其在欠采样加速采集下的鲁棒性。
Systematic functional drug testing in patient-derived models reveals ex vivo sensitivities associated with clinical outcome in rare solid tumors
该研究建立了一种适用于罕见实体瘤的活检兼容型外体药物敏感性测试平台，证实了其在临床时间框架内的可行性，并发现体外药物敏感性结果与患者的临床获益及无进展生存期显著相关，从而支持将其作为精准肿瘤学中辅助治疗分层的有效手段。
Precision single-cell profiling of Circulating Tumour Cells: novel markers and data-driven characterization by CTCeek
该研究通过分析 3302 个单细胞转录组数据，鉴定了包括 CLDN4、TM4SF1 等在内的新型 CTC 标志物以克服传统 EPCAM 检测的局限，并开发了首个自动注释真实 CTC 的在线工具 CTCeek。
Molecular and Structural Reprogramming of Gastric Cancer Revealed by Systems-Level Transcriptomic Analysis
该研究通过整合转录组学与网络分析框架，揭示了胃癌进展涉及染色质水平的发育重编程、胃分化程序持续丧失以及 FGFR 驱动的致癌信号通路，从而为胃癌的诊断、预后及靶向治疗提供了新的分子病理学依据。
Transcriptomics and mutational analysis to screen immunogenic neoantigen peptides and Patient stratification based on immune subtypes for TNBC
本研究通过整合转录组与突变分析，在三阴性乳腺癌中鉴定出 POSTN 和 CAP1 等肿瘤特异性抗原及高潜力新抗原肽，并基于免疫亚型将患者分为预后不同的四类，提出利用新抗原疫苗将“免疫冷”亚型转化为“免疫富集”表型，同时筛选出与生存改善相关的免疫生物标志物以辅助预后评估和疫苗疗效监测。
Comparative modes of chromatin engagement by PAX::FOXO1 fusions in rhabdomyosarcoma
该研究通过跨物种比较肿瘤学方法，首次揭示了 PAX3::FOXO1 和 PAX7::FOXO1 融合蛋白在横纹肌肉瘤中均能结合核小体 DNA 并发挥先锋转录因子功能，但两者在基序偏好、组蛋白修饰共定位及靶基因选择上存在关键机制差异，从而解释了其临床预后的不同。
Multiomic profiling of human and canine soft-tissue sarcomas reveals extensive molecular homology across species and identifies clinically relevant subgroups
该研究通过多组学分析揭示了人类与犬类软组织肉瘤（特别是纤维肉瘤和黏液性纤维肉瘤）之间存在广泛的分子同源性，不仅证实了两者在分子层面构成连续谱系而非独立实体，还识别出具有临床意义的亚群及新的犬类亚型，从而确立了犬类模型在转化医学中的关键价值。
Molecular profiling of glioblastoma-derived extracellular vesicles identifies small nucleolar RNAs as candidate liquid biomarkers for radiation-induced senescence
该研究通过分子谱分析发现，胶质母细胞瘤来源的细胞外囊泡中富含的小核仁 RNA（snoRNAs）可作为辐射诱导衰老的潜在液体生物标志物，为开发衰老靶向疗法的伴随诊断提供了新途径。
Polyclonal and clonal organoid models of Barrett oesophagus and oesophageal adenocarcinoma reveal heterogeneity in progression and therapy response
该研究构建了涵盖从正常食管到巴雷特食管及食管腺癌的多克隆与单克隆类器官模型库，不仅重现了疾病的异质性特征，还揭示了亚克隆群体在疾病进展及化疗、放疗和靶向治疗中反应差异的关键作用。
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
该研究利用体外和体内模型证实，维生素 D 缺乏会阻碍前列腺上皮细胞分化、扰乱雄激素信号通路并增强前列腺癌侵袭性，从而支持通过补充维生素 D 来降低高危人群患前列腺癌的风险。
In Vivo Selection of anti-glioblastoma DNA aptamer-drug conjugates in an orthotopic patient-derived xenograft model
该研究利用原位患者来源异种移植（PDX）胶质母细胞瘤小鼠模型和庞大的 DNA 适配体 - 药物偶联物（ApDC）库，通过体内 SELEX 技术成功筛选出能克服血脑屏障并靶向胶质母细胞瘤的新型 ApDC，为开发更有效的 GBM 疗法提供了无偏倚的新策略。